电泳缓冲液是核酸和蛋白质在凝胶电泳系统中的一个重要组成部分，它既是电泳场中的导体，也是维持电泳系统恒定pH值的关键因素。常见的核酸电泳缓冲液包括TAE、TBE、TPE和MOPS等。

电泳缓冲液的特点

TAE是最常用的电泳缓冲系统。其优势在于在电泳过程中，超螺旋DNA的迁移与其实际相对分子质量更加吻合（相比之下，使用TBE时测得的相对分子质量往往偏大）。此外，双链线性DNA在TAE缓冲液中的迁移率通常比其他两种缓冲液快约10%。对大于13kb的DNA片段，使用TAE能获得更好的分离效果，并且在回收DNA片段时，TAE缓冲系统同样具有简便的优势。然而，TAE的缺点是其缓冲容量较小，因此在长时间电泳（如过夜）时不建议使用，除非配备有循环装置以实现两极间缓冲液的交换。

TBE则以其强大的缓冲能力而著称，适合长时间电泳，并在电泳小于1kb的片段时表现优异。但在琼脂糖凝胶中使用时，易造成高电渗作用，并由于其与琼脂糖形成的非共价结合的四羟基硼/酸盐复合物，降低了DNA片段的回收率，因此不适合用于回收电泳。

TPE的缓冲能力同样较强，但因磷酸盐在乙醇沉淀过程中易析出，故不适合用于DNA片段的回收电泳。

电泳缓冲液的功能

电泳缓冲液在电泳过程中的主要功能之一是维持合适的pH值。电泳过程中，阳极和阴极都会发生电解反应，阳极发生氧化反应（4OH^- → 4e^- + 2H₂O + O₂），阴极发生还原反应（4H⁺ + 4e^- → 2H₂）。如果电泳时间过长，阳极会变酸而阴极变碱。因此，一个优质的缓冲系统应具有强大的缓冲能力，以保持电泳过程中两极的pH值基本不变。

其次，电泳缓冲液还使溶液具备一定的导电性，从而促进DNA分子的迁移。一般来说，电泳缓冲液中应含有0.01-0.04 mol/L的Na⁺离子。若Na⁺离子浓度过低，电泳速度将减缓；而浓度过高则会导致电流过大，使得凝胶过热甚至融化。

最后，电泳缓冲液中通常还含有EDTA，其浓度为1-2 mmol/L，以螯合Mg²⁺离子，防止电泳过程中激活DNA酶，并阻止Mg²⁺离子与核酸生成沉淀。

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